O problema é que otransform valor da propriedade tem várias partes comotranslate, scale etc.

Esta é uma pergunta teórica sobre elemento, vamos.loader isso temtransform:translate(10px, 10px) e na animação eu quero animar oscale propriedade. Nesse caso, o navegador não aceita otransform:translate(10px, 10px) e levará apenas oscale.

Estou procurando uma maneira de contornar este problema.

Aqui está um exemplo para esta pergunta. Por favor, lembre-se de que não estou procurando uma resposta para este exemplo específico (como: quebrar o elemento ou adicionar o elementotranslate valor para a definição de animação), mas uma solução genérica (se existir, é claro).

.loading {
  position: relative;
  width: 100px;
  height: 100px;
  background: #eee;
}
.loading:before,
.loading:after {
  content: "";
  width: 50%;
  height: 50%;
  -moz-border-radius: 50%;
  -webkit-border-radius: 50%;
  border-radius: 50%;
  background-color: #fff;
  opacity: 0.6;
  position: absolute;
  top: 0;
  left: 0;
  /* the broswer doesn't take this */
  transform: translate(100px, 300px);
  -webkit-animation: bounce 2s infinite ease-in-out;
  animation: bounce 2s infinite ease-in-out;
}
.loading:after {
  -webkit-animation-delay: -1s;
  animation-delay: -1s;
}
@keyframes bounce {
  0%, 100% {
    transform: scale(0);
    -webkit-transform: scale(0);
  }
  50% {
    transform: scale(1);
    -webkit-transform: scale(1);
  }
}

<div class="loading"></div>