executar chroot na janela de encaixe

Eu tenho um aplicativo comercial, enviado em um ambiente chroot: o script de inicialização está fazendo o chroot e iniciando o exe.

O aplicativo é bastante complexo e, também para fins de suporte, não quero alterar todo o ambiente.

É possível executar chroot e iniciar o serviço na janela de encaixe? Ou os dois são incompatíveis?