Diferença entre executar fiapos no menu do Android Studio e linha de comando gradlew

Quando executo o seguinte em uma linha de comando:

./gradlew -lint

Eu obtenho resultados diferentes do que se eu escolher a seguinte opção de menu no Android Studio.

Analyze->Inspect Code...

Alguém pode explicar isso? Isso é normal? Um desenvolvedor prudente deve executar os dois para encontrar todos os problemas em potencial com seu projeto?

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