Como uma elipse de dados pode ser sobreposta a um gráfico de dispersão ggplot2?
Eu tenho uma função R que produz elipses de confiança de 95% para gráficos de dispersão. A saída se parece com isso, com um padrão de 50 pontos para cada elipse (50 linhas):
[,1] [,2]
[1,] 0.097733810 0.044957994
[2,] 0.084433494 0.050337990
[3,] 0.069746783 0.054891438
Gostaria de sobrepor várias dessas elipses para cada nível de um fator chamado 'site' em umggplot2
scatterplot, produzido a partir deste comando:
> plat1 <- ggplot(mapping=aes(shape=site, size=geom), shape=factor(site)); plat1 + geom_point(aes(x=PC1.1,y=PC2.1))
Isso é executado em um conjunto de dados, chamadodflat
que fica assim:
site geom PC1.1 PC2.1 PC3.1 PC1.2 PC2.2
1 Buhlen 1259.5649 -0.0387975838 -0.022889782 0.01355317 0.008705276 0.02441577
2 Buhlen 653.6607 -0.0009398704 -0.013076251 0.02898955 -0.001345149 0.03133990
O resultado é bom, mas quando tento adicionar a elipse (digamos neste site, chamado "Buhlen"):
> plat1 + geom_point(aes(x=PC1.1,y=PC2.1)) + geom_path(data=subset(dflat, site="Buhlen"),mapping=aes(x=ELLI(PC1.1,PC2.1)[,1],y=ELLI(PC1.1,PC2.1)[,2]))
Recebo uma mensagem de erro:"Error in data.frame(x = c(0.0977338099339815, 0.0844334944904515, 0.0697467834016782, : arguments imply differing number of rows: 50, 211
Consegui consertar isso no passado, mas não me lembro como. Parece que geom_path está confiando nos mesmos pontos, em vez de plotar novos. Qualquer ajuda seria apreciada.