Excluir colunas em arquivos de texto com uma sequência específica
Gostaria de excluir colunas com uma sequência específica "Gtype". a partir de um arquivo delimitado por tab .txt. Eu já tentei este comando no R:df <- df[, -grep("GType.", colnames(df))] para executar esta tarefa. No entanto, minha matriz é muito grande (mais de 13 GB) e R não pode lidar com isso. (Erro: não é possível alocar vetor de tamanho ....)
Meu arquivo de entrada:
Log.NE122 Gtype.NE122 Log.NE144 Gtype.NE144
-0.33 AA 1.0 AB
Minha saída esperada:
Log.NE122 Log.NE144
-0.33 1.0
Eu estou querendo saber que funciona no bash. Se alguém tiver outras opções ....