Eu tenho um projeto npm que usa jquery.

var $ = require('jquery');

Eu também tenho um arquivo html de índice que faz referência ao bootstrap.

<link href="//netdna.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.1.0/css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet"/>

<script type="text/javascript" src="my-script.js"></script>
<script src="//cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/jquery/2.1.0/jquery.min.js"></script>

<script src="//netdna.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.1.0/js/bootstrap.min.js"></script>

Agora eu preciso de uma carga separada para jquery para bootstrap, pois depende disso? Eu estava usando recentementejqueryify ao invés dejquery e eu não precisava da carga separada.

Alguém pode recomendar um padrão de carregamento para inicialização com o uso de require?