Encontrei esse problema recentemente (alguns dias atrás, tudo estava funcionando bem): o Visual Studio 2012 começou a se recusar a criar projetos WP8 nativos.

Hoje, criei uma nova solução a partir do modelo 'Windows Phone Direct3D App (somente nativo)' para verificar se minhas DLLs recém-criadas terão suporte adequado no WP. Tentei compilar este projeto, primeiro sem alterações ou referências adicionais - código puro gerado pelo VS. No entanto, falhou com o erro fornecido. Sei muito bem o que isso significa e qual poderia ser o motivo possível, mas não consigo entender, de onde vem isso neste caso. Estranho: isso só acontece na configuração 'Win32', o ARM compila bem:

1>------ Build started: Project: PhoneDirect3DApp, Configuration: Debug ARM ------
.......

Build Summary
-------------
00:11.742 - Success - Debug ARM - PhoneDirect3DApp\PhoneDirect3DApp.vcxproj

mas o Win32 não:

1>------ Build started: Project: PhoneDirect3DApp, Configuration: Debug Win32 ------
.......
1>LINK : fatal error LNK1104: cannot open file 'kernel32.lib'

Build Summary
-------------
00:09.725 - Failed  - Debug Win32 - PhoneDirect3DApp\PhoneDirect3DApp.vcxproj

Meus projetos padrão (C ++ / Win32 nativo) também funcionam como esperado (nos destinos de plataforma Win32 e x64).

Configuração do projeto: (em ambas as plataformas)

Linker :: Entrada:

d3d11.lib;%(AdditionalDependencies)

Linker :: Ignorar:

ole32.lib;%(IgnoreSpecificDefaultLibraries)

Diretórios VC ++:

Microsoft.ARM.Cpp.User:

$(WP80ToolSetPath)lib\arm;$(WindowsSDK_LibraryPath_ARM);

Microsoft.Win32.Cpp.User:

$(VCInstallDir)lib;$(VCInstallDir)atlmfc\lib;$(WP80ToolSetPath)lib\x86;$(WindowsSDK_LibraryPath_x86)

Alguma idéia do que mais poderia estar errado ou configurado incorretamente? Estou ficando sem idéias, nunca vi algo assim antes.

A propósito, notei mais uma alteração: quando eu estava tentando compilar projetos WP8 na configuração do ARM antes, sempre havia um erro dizendo que "a criação de aplicativos ARM na área de trabalho não é suportada" (ou algo parecido). Agora o ARM é compilado sem nenhum problema. Isso é normal?