setwd em um arquivo Rmd no RStudio não parece alterar o diretório em partes subseqüentes. Existe uma maneira de definir o diretório de trabalho para o bem?

Exemplo:

```{r}
setwd("/tmp")
getwd()
```

```{r}
getwd()
```

Saída:

setwd("/tmp")
getwd()
## [1] "/private/tmp"

getwd()
## [1] "/Users/me/src"

Isso está no Mac OS 10.8.5 usando o RStudio 0.97.551, o R versão 3.0.2 e o knitr versão 1.5.

Desejo definir o diretório uma vez para todos os blocos subseqüentes.