Preferido é este:

template<typename T>
bool isNotZero(const T &a)
{
    if (std::is_floating_point<T>::value) return abs(a) > std::numeric_limits<T>::epsilon();
    else return a;
}

Ou isto:?

template<typename T>
std::enable_if<std::is_floating_point<T>::value, bool>::type
isNotZero(const T &a) { return abs(a) > std::numeric_limits<T>::epsilon(); }

template<typename T>
std::enable_if<std::is_integral<T>::value, bool>::type
isNotZero(const T &a) { return a; }

Eu costumo usar o primeiro tipo para evitar muitas versões da função.

Eu acredito que é exatamente o mesmo.

A primeira versão otimizada no estágio opcode e a segunda versão no estágio de instanciação de modelos.