Eu estou usando esta função da minha aplicação web para chamar o arquivo exe. Quando ele chama o arquivo .exe tudo acontece com precisão, eu posso vê-lo como processo em execução nos processos do gerenciador de tarefas, mas por que não o prompt de comando abre quando este processo é chamado.

o aplicativo da web está hospedado no iis do mesmo sistema.

 public void RunconsoleApplication(string Id)
    {
        // Get the file path of your Application (exe)
        string filePath = @"E:/ConsoleApplication1/ConsoleApplication1/bin/Debug/ConsoleApplication1.exe";

        System.Diagnostics.ProcessStartInfo info = new System.Diagnostics.ProcessStartInfo(filePath, Id);

        System.Diagnostics.Process p = System.Diagnostics.Process.Start(info);//called       

    }

Atualizada

Quando executar o mesmo aplicativo no atudio visual, o prompt de comando é aberto. mas não quando hospedado em iis