A permissão é concedida apenas ao aplicativo do sistema

eu tenho umAplicativo do sistema que usa permissões do sistema e tenho essas permissões listadas no manifesto. Eclipse dá o seguinteerro quando tento fazer uma compilação (a construção da linha de comando funciona):

A permissão é concedida apenas para aplicativos do sistema

Eu já estou ciente de que meu aplicativo requer permissões do sistema e não é um problema para mim porque meu aplicativo será usado apenas em telefones com raiz. Então eu quero suprimir esse erro, alguém sabe como?

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Meu projeto já compila bem na linha de comando, instala, executa etc .. Meu problema é sobre eclipse dando um erro para um arquivo de manifesto legítimo.

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