Eu tenho um arquivo que se parece com isso ..

"Locations" "X9442" "X5997"
"1" "cg00000957"    0.87    0.86
"2" "cg00001349"    0.78    0.78
"3" "cg00001583"    0.06    0.08
"4" "cg00002028"    0.01    0.01

Desejo remover os nomes das linhas e torná-las como segue:

 "Locations"    "X9442" "X5997"
 "cg00000957"   0.87    0.86
 "cg00001349"   0.78    0.78
 "cg00001583"   0.06    0.08
 "cg00002028"   0.01    0.01

Eu tentei várias coisas, mas não consigo remover esses índices enquanto faço write.table. Também às vezes o cabeçalho "Locations" muda sua coluna. Alguém pode me ajudar como faço para alcançar o acima em R ou Linux?