Eu tenho procurado por algum tempo, e mastigando meu chapéu no processo, mas não consigo encontrar uma correspondência exata para o meu problema.
Para resumir, estou obtendo um excelente rastreamento de pilha (org.apache.tomcat.jdbc.pool.ConnectionPool abandonar) após 60 segundos de inatividade, que é um comportamento normal para alguns threads do lado do servidor.
Estou usando o pool de conexão Tomcat JDBC (org.apache.tomcat.jdbc.pool.DataSource) diretamente
Rastreamento de pilha:

    Oct 29, 2012 8:55:50 PM org.apache.tomcat.jdbc.pool.ConnectionPool abandon
    WARNING: Connection has been abandoned PooledConnection[com.mysql.jdbc.JDBC4Connection@1ad2916]:java.lang.Exception
        at org.apache.tomcat.jdbc.pool.ConnectionPool.getThreadDump(ConnectionPool.java:967)
        at org.apache.tomcat.jdbc.pool.ConnectionPool.borrowConnection(ConnectionPool.java:721)
        at org.apache.tomcat.jdbc.pool.ConnectionPool.borrowConnection(ConnectionPool.java:579)
        at org.apache.tomcat.jdbc.pool.ConnectionPool.getConnection(ConnectionPool.java:174)
        at org.apache.tomcat.jdbc.pool.DataSourceProxy.getConnection(DataSourceProxy.java:111)
        at com.getsom.getConnection(DAO.java:1444)
        at com.getsom.PreparedConnection.(PreparedConnection.java:48)
        at com.getsom.Alarms.run(Alarms.java:492)

Meu PoolProperties é configurado da seguinte maneira:

    PoolProperties pp = new PoolProperties();

    pp.setUrl( someValidUrl);
    pp.setDriverClassName("com.mysql.jdbc.Driver");
    pp.setUsername( someUser);
    pp.setPassword( somePassword);
    pp.setJmxEnabled( true);
    pp.setTestWhileIdle( true);
    pp.setTestOnBorrow( true);
    pp.setValidationQuery( "SELECT 1");
    pp.setTestOnReturn( false);
    pp.setValidationInterval(30000);
    pp.setTimeBetweenEvictionRunsMillis(30000);
    pp.setMaxActive(100);
    pp.setInitialSize(10);
    pp.setMaxWait(10000);
    pp.setMinEvictableIdleTimeMillis(30000);
    pp.setMinIdle(10);

    pp.setLogAbandoned(true);
    pp.setRemoveAbandoned(true);
    pp.setRemoveAbandonedTimeout(60);
    pp.setJdbcInterceptors("org.apache.tomcat.jdbc.pool.interceptor.ConnectionState;"+
      "org.apache.tomcat.jdbc.pool.interceptor.StatementFinalizer");    

    setPoolProperties(pp);

Eu estava esperando setValidationInterval (30000) me salvaria, desde que 30s não é muito em um ciclo de vida da conexão. De qualquer forma, a questão é:
O que estou perdendo para manter esta conexão viva para sempre?
Um bom saber: Por que estou expirando na função que reivindicou a conexão, embora tenha sido invocada 30 segundos antes.