Resultados de la búsqueda a petición "dendrogram"
Cambiar hojas de dendrograma
Quiero modificar las propiedades de las hojas en un dendrograma producido a partir de la trama de un objeto hclust. Como mínimo, quiero cambiar los colores, pero cualquier ayuda que pueda brindar será apreciada. Intenté buscar en Google la ...
¿Cómo se compara la "similitud" entre dos dendrogramas (en R)?
Tengo dos dendrogramas que deseo comparar entre sí para descubrir cuán "similares" son. Pero no conozco ningún método para hacerlo (y mucho menos un código para implementarlo, por ejemplo, en R). ¿Alguna pista? ACTUALIZAR(2014-09-13): Desde ...
Colorear ramas de dendrograma usando una columna existente
Tengo un marco de datos que estoy tratando de agrupar. estoy usandohclust ahora mismo. En mi marco de datos, hay unFLAG columna en la que me gustaría colorear el dendrograma. Por la imagen resultante, estoy tratando de descubrir similitudes entre ...
Cómo colorear las etiquetas de un dendrograma por una variable de factor adicional en R
He producido un dendrograma después de ejecutar un análisis de agrupamiento jerárquico en R usando el siguiente código. Ahora estoy tratando de colorear las etiquetas de acuerdo con otra variable de factor, que se guarda como un vector. Lo más ...
¿Cómo colorear las ramas y las etiquetas de marca en el mapa de calor.2?
He hecho un mapa de calor usando la funciónheatmap.2 degplots en R, pero no tengo idea de cómo colorear las ramas y marcar las etiquetas por grupos (por ejemplo, si corté el árbol para tener cuatro grupos como en mi segunda figura). He comprobado ...
El dendrograma generado por scipy-cluster no muestra
estoy usandoscipy-cluster [http://code.google.com/p/scipy-cluster/]para generar una agrupación jerárquica en algunos datos. Como paso final de la aplicación, llamo aldendrogram [http://users.soe.ucsc.edu/~eads/cluster.html#-dendrogram] función ...
¿Cómo colorear las etiquetas de un dendrograma según grupos definidos? (en R)
Tengo una matriz numérica en R con 24 filas y 10,000 columnas. Los nombres de fila de esta matriz son básicamente nombres de archivo de los cuales he leído los datos correspondientes a cada una de las 24 filas. Aparte de esto, tengo una lista de ...
R corte el dendrograma en grupos con tamaño mínimo
¿Hay una manera fácil de calcular el valor más bajo deh encut que produce agrupaciones de un tamaño mínimo dado? En este ejemplo, si quisiera grupos con al menos diez miembros cada uno, debería ir conh = 3.80: # using iris data simply for ...
Usando R para agrupar basado en la distancia euclidiana y una métrica de enlace completa, ¿demasiados vectores?
Estoy tratando de descubrir cómo leer en una matriz de recuento en R, y luego agruparlo según la distancia euclidiana y una métrica de enlace completa. La matriz original tiene 56,000 filas (genes) y 7 columnas (tratamientos). Quiero ver si hay ...
Colorea las etiquetas de las marcas en un dendrograma para que coincida con los colores del grupo
¿Cómo puedo colorear individualmente las etiquetas de un dendrograma para que coincidan con los colores de los grupos en MATLAB? Aquí hay un ejemplo de salida deseada generada usando el código en mi respuesta a continuación (tenga en cuenta que ...