En mi última pregunta "Base de datos portátil para almacenar secretos"la mejor respuesta hasta ahora diga que use sqlite-crypt.

Leyendo documentos sqlite-crypt, el nuevo parámetro para abrir la base de datos es la frase de contraseña. Por supuesto, no quiero codificar la contraseña, así que estaba pensando cuál es el mejor, simple y rápido método para almacenar esa contraseña.