Agregar nuevos nodos al diseño dirigido por la Fuerza

Primera pregunta sobre Stack Overflow, ¡así que tengan paciencia conmigo! Soy nuevo en d3.js, pero siempre me ha sorprendido lo que otros pueden lograr con él ... ¡y casi tan asombrado por lo poco que he podido hacer con él! Claramente no estoy asimilando algo, así que espero que las almas amables aquí puedan mostrarme la luz.

Mi intención es crear una función de JavaScript reutilizable que simplemente haga lo siguiente:

Crea un gráfico de fuerza forzada en blanco en un elemento DOM especificado Le permite agregar y eliminar nodos etiquetados con imagen en ese gráfico, especificando conexiones entre ellos

Me he tomadohttp: //bl.ocks.org/95064 como punto de partida, ya que ese es esencialmente el tipo de diseño que quiero poder crear:

Así es como se ve mi código:

<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
    <script type="text/javascript" src="jquery.min.js"></script>
    <script type="text/javascript" src="underscore-min.js"></script>
    <script type="text/javascript" src="d3.v2.min.js"></script>
    <style type="text/css">
        .link { stroke: #ccc; }
        .nodetext { pointer-events: none; font: 10px sans-serif; }
        body { width:100%; height:100%; margin:none; padding:none; }
        #graph { width:500px;height:500px; border:3px solid black;border-radius:12px; margin:auto; }
    </style>
</head>
<body>
<div id="graph"></div>
</body>
<script type="text/javascript">

function myGraph(el) {

    // Initialise the graph object
    var graph = this.graph = {
        "nodes":[{"name":"Cause"},{"name":"Effect"}],
        "links":[{"source":0,"target":1}]
    };

    // Add and remove elements on the graph object
    this.addNode = function (name) {
        graph["nodes"].push({"name":name});
        update();
    }

    this.removeNode = function (name) {
        graph["nodes"] = _.filter(graph["nodes"], function(node) {return (node["name"] != name)});
        graph["links"] = _.filter(graph["links"], function(link) {return ((link["source"]["name"] != name)&&(link["target"]["name"] != name))});
        update();
    }

    var findNode = function (name) {
        for (var i in graph["nodes"]) if (graph["nodes"][i]["name"] === name) return graph["nodes"][i];
    }

    this.addLink = function (source, target) {
        graph["links"].push({"source":findNode(source),"target":findNode(target)});
        update();
    }

    // set up the D3 visualisation in the specified element
    var w = $(el).innerWidth(),
        h = $(el).innerHeight();

    var vis = d3.select(el).append("svg:svg")
        .attr("width", w)
        .attr("height", h);

    var force = d3.layout.force()
        .nodes(graph.nodes)
        .links(graph.links)
        .gravity(.05)
        .distance(100)
        .charge(-100)
        .size([w, h]);

    var update = function () {

        var link = vis.selectAll("line.link")
            .data(graph.links);

        link.enter().insert("line")
            .attr("class", "link")
            .attr("x1", function(d) { return d.source.x; })
            .attr("y1", function(d) { return d.source.y; })
            .attr("x2", function(d) { return d.target.x; })
            .attr("y2", function(d) { return d.target.y; });

        link.exit().remove();

        var node = vis.selectAll("g.node")
            .data(graph.nodes);

        node.enter().append("g")
            .attr("class", "node")
            .call(force.drag);

        node.append("image")
            .attr("class", "circle")
            .attr("xlink:href", "https://d3nwyuy0nl342s.cloudfront.net/images/icons/public.png")
            .attr("x", "-8px")
            .attr("y", "-8px")
            .attr("width", "16px")
            .attr("height", "16px");

        node.append("text")
            .attr("class", "nodetext")
            .attr("dx", 12)
            .attr("dy", ".35em")
            .text(function(d) { return d.name });

        node.exit().remove();

        force.on("tick", function() {
          link.attr("x1", function(d) { return d.source.x; })
              .attr("y1", function(d) { return d.source.y; })
              .attr("x2", function(d) { return d.target.x; })
              .attr("y2", function(d) { return d.target.y; });

          node.attr("transform", function(d) { return "translate(" + d.x + "," + d.y + ")"; });
        });

        // Restart the force layout.
        force
          .nodes(graph.nodes)
          .links(graph.links)
          .start();
    }

    // Make it all go
    update();
}

graph = new myGraph("#graph");

// These are the sort of commands I want to be able to give the object.
graph.addNode("A");
graph.addNode("B");
graph.addLink("A", "B");

</script>
</html>

Cada vez que agrego un nuevo nodo, vuelve a etiquetar todos los nodos existentes; estos se apilan unos encima de otros y las cosas comienzan a ponerse feas. Entiendo por qué es esto: porque cuando llamo a laupdate() función función al agregar un nuevo nodo, hace unnode.append(...) a todo el conjunto de datos. No puedo entender cómo hacer esto para solo el nodo que estoy agregando ... y aparentemente solo puedo usarnode.enter() para crear un solo elemento nuevo, de modo que no funcione para los elementos adicionales que necesito enlazar al nodo. ¿Cómo puedo arreglar esto

¡Gracias por cualquier orientación que puedas dar sobre cualquiera de estos problemas!

Editado porque rápidamente arreglé una fuente de varios otros errores que se mencionaron anteriormente

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