ásicamente, tengo dos archivos con cadenas separados por una nueva línea.

Lo que deseo hacer es obtener la primera cadena del primer archivo y compararla con TODAS las cadenas del segundo archivo. Luego obtenga la segunda cadena del primer archivo y compárela con TODAS las cadenas del segundo archivo, luego obtenga la tercera y etc., etc.

Actualmente tengo este código, pero no estoy seguro de si funciona como deseo que sea

$file = file_get_contents("file1.txt");
$pieces = explode("\n", trim($file));
foreach($pieces as $piece)
{
    $file2 = file_get_contents("file2.txt");
    $pieces2 = explode("\n", trim($file2));
    foreach($pieces2 as $piece2)
    {
        if($piece == $piece2)
        echo 'yes';
    }
}