¿Actualizar la versión de Android limpia los datos de la aplicación?

Recibí un extraño informe de error:

Después de una actualización OTA del SO de 2.1 a 2.2, las preferencias compartidas se han borrado, lo que hace que mi aplicación vuelva a la pantalla de la primera vez.

¿Es este un comportamiento normal, borrado de SharedPreferences en la actualización del sistema aunque manteniendo la aplicación instalada?

Gracias

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