Mi escenario:

Una plantilla PDF con campos de formulario: template.pdfUn archivo XFDF que contiene los datos que se deben completar: fieldData.xfdf

Ahora necesito tener estos archivos combinados y aplanados. pdftk hace el trabajo fácilmente dentro de php:

exec("pdftk template.pdf fill_form fieldData.xfdf output flatFile.pdf flatten");

Desafortunadamente, esto no funciona con soporte completo de utf-8. Por ejemplo: las letras cirílicas y griegas se mezclan. Usé Arial para esto, con un conjunto de caracteres Unicode.

¿Cómo puedo lograr aplanar mis archivos Unicode?¿Existe alguna otra herramienta pdf que ofrezca soporte Unicode?¿Tiene pdftk un interruptor Unicode que me falta?

EDITAR 1: como esta pregunta no se ha resuelto durante más de 9 meses, decidí comenzar una recompensa por ello. En caso de que haya opciones para patrocinar una función o una corrección de errores en pdftk, me encantaría donar.

EDIT 2: ya no estoy trabajando en este proyecto, por lo que no puedo verificar nuevas respuestas. Si alguien tiene un problema similar, me alegra si puede responder a mi favor.