Muchos a muchos hibernan lado inverso ignorado

Hola estoy leyendo la documentación de hibernación.

http://docs.jboss.org/hibernate/annotations/3.5/reference/en/html/entity.html

Una asociación de muchos a muchos se define de forma lógica mediante la anotación @ManyToMany. También debe describir la tabla de asociación y las condiciones de unión utilizando la anotación @JoinTable. Si la asociación es bidireccional, un lado debe ser el propietario y el otro lado debe ser el final inverso (es decir, se ignorará al actualizar los valores de la relación en la tabla de asociación):

Entiendo todo menos el ultimo

(es decir, se ignorará al actualizar los valores de la relación en la tabla de asociación).

¿Qué significa esto? ¿Ejemplo?

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