Referencia cruzada en un documento de registro de un solo archivo

Una de las promesas del paquete bookdown es funciones para la numeración automática de subtítulos de figuras / tablas y referencias cruzadas de figuras / tablas / secciones.

Se afirma que está habilitado para la reserva de un solo Rmd, si usamosbookdown::html_document2 en el YAML:https://bookdown.org/yihui/bookdown/a-single-document.html

Mirando a larmarkdown en bruto para ese capítulo del manual de bookdown, he intentado seguir las instrucciones para crear un único archivo Rmd que pueda usar esas funciones de referencias cruzadas. Pero no puedo hacer que se procese como se esperaba, con referencias cruzadas.

Aquí hay un ejemplo simple de Rmd:

---
output: bookdown::html_document2
---

Here's the cross-ref: \@ref(fig:cars-fig) 

Here's the figure:

```{r cars-fig, fig.cap = 'Here is a plot about cars'}
plot(cars)
```

Aquí está el resultado que obtengo cuando hago clic en el botón de punto en RStudio, las referencias cruzadas no funcionan como se esperaba:

¿Cómo puedo obtener referencias cruzadas para mostrar números de figuras y ser un enlace en vivo a la figura? ¿Y cómo puedo hacer que el título se formatee como se espera?

Aquí está la información de mi sesión:

> devtools::session_info()
Session info -------------------------------------------------------
 setting  value                       
 version  R version 3.3.0 (2016-05-03)
 system   x86_64, mingw32             
 ui       RStudio (0.99.846)          
 language (EN)                        
 collate  English_Australia.1252      
 tz       Australia/Sydney            
 date     2016-07-02                  

Packages -----------------------------------------------------------
 package   * version date       source                           
 bookdown    0.0.74  2016-07-01 Github (rstudio/bookdown@8333bbb)
 devtools    1.12.0  2016-06-24 CRAN (R 3.3.1)                   
 digest      0.6.9   2016-01-08 CRAN (R 3.3.0)                   
 htmltools   0.3.5   2016-03-21 CRAN (R 3.2.4)                   
 httpuv      1.3.3   2015-08-04 CRAN (R 3.2.3)                   
 memoise     1.0.0   2016-01-29 CRAN (R 3.2.5)                   
 mime        0.4     2015-09-03 CRAN (R 3.2.2)                   
 miniUI      0.1.1   2016-01-15 CRAN (R 3.2.4)                   
 R6          2.1.2   2016-01-26 CRAN (R 3.2.5)                   
 Rcpp        0.12.5  2016-05-14 CRAN (R 3.3.0)                   
 rmarkdown   0.9.6   2016-05-01 CRAN (R 3.3.0)                   
 rsconnect   0.4.3   2016-05-02 CRAN (R 3.3.0)                   
 shiny       0.13.2  2016-03-28 CRAN (R 3.2.4)                   
 withr       1.0.2   2016-06-20 CRAN (R 3.3.0)                   
 xtable      1.8-2   2016-02-05 CRAN (R 3.2.5)                   
 yaml        2.1.13  2014-06-12 CRAN (R 3.2.2)  

Respuestas a la pregunta(1)

Su respuesta a la pregunta