Ejecución de Python desde php

Estoy llamando a python desde php usando el comando "exec ('python args')". Este comando no funciona por más de 1 minuto, pero Python aún se está ejecutando en segundo plano y PHP está abortando. En este caso algunas veces hay múltiples llamadas a python. Para aumentar el tiempo de ejecución modifiqué:

/etc/php5/fpm/php.ini : max_execution_time = 900/etc/php5/fpm/pool.d/www.conf : request_terminate_timeout=900/etc/nginx/nginx.conf : http{ fastcgi_read_timout=900;}

Si el tiempo de ejecución es inferior a 1 minuto, no hay problemas, python y php están funcionando.