He golpeado el contador corriendo en Java. Funciona las 24 horas y los golpes pasan a aproximadamente 100 veces por segundo. Durante el día, el tiempo de procesamiento del GC aumenta lentamente de 20-60 ms hasta 10000-60000 ms y luego baja a 20-60 ms. Tal patrón se repite de vez en cuando. A partir de los registros de GC encontré que la mayor parte del tiempo gastado en GC para procesar objetos de referencia (proceso de referencia). Entonces, ¿cuáles son las causas de un tiempo de GC tan largo?

Server: Amazon EC2 m1.small
OS: Ubuntu 10.04.3 LTS
Java: Oracle 1.7.0_07

Ejemplo de registros de GC:

2012-09-13T16:51:20.091+0400: 167239.936: [GC pause (young), 62.58395400 secs]
...
[Other: 62489.7 ms]
    [Choose CSet:   0.0 ms]
    [Ref Proc: 62433.9 ms]
    [Ref Enq:   0.0 ms]
    [Free CSet:   0.7 ms]
[Eden: 200M(200M)->0B(199M) Survivors: 4096K->5120K Heap: 578M(1024M)->380M(1024M)]

Tiempo - gráfico "Ref Proc":

09:37:59 - 242.4 ms
09:38:50 - 226.0 ms
09:39:00 - 83.6 ms
...
11:45:22 - 451.8 ms
11:46:04 - 489.3 ms
11:46:46 - 505.6 ms
...
14:05:40 - 1027.3 ms
14:06:01 - 796.6 ms
14:06:35 - 1064.0 ms
...
15:44:32 - 1920.4 ms
15:45:04 - 2116.7 ms
15:45:39 - 2196.8 ms
...
16:19:07 - 3983.3 ms
16:19:43 - 4494.9 ms
16:20:16 - 4065.2 ms
...
16:33:11 - 7690.1 ms
16:33:50 - 8501.4 ms
16:34:28 - 8059.3 ms
...
16:47:14 - 51378.6 ms
16:49:11 - 57529.2 ms
16:51:20 - 62433.9 ms
16:53:00 - 46.1 ms
16:53:30 - 45.5 ms
16:54:03 - 45.0 ms
...
16:54:38 - 57.0 ms
16:55:09 - 20.9 ms
16:55:43 - 21.3 ms
...
16:09:45 - 134.3 ms
16:10:21 - 142.1 ms
16:10:58 - 147.5 ms
...
17:18:51 - 177.3 ms
17:19:27 - 135.8 ms
17:20:03 - 179.6 ms

Encontré en las fuentes Java el parámetro PrintReferenceGC. El registro de GC se muestra a continuación

[SoftReference, 0 refs, 0.0000050 secs]
[WeakReference, 6 refs, 0.0000030 secs]
[FinalReference, 113 refs, 0.0011180 secs]
[PhantomReference, 0 refs, 0.0000020 secs]
[JNI Weak Reference, 3.9010450 secs]

Este es un problema de JNI Weak Reference.