La transformación ASP.NET Web.config no funcionará en el instalador

Estoy trabajando en un proyecto ASP.NET en Visual Studio .NET 2010 e intento hacer un instalador MSI usando un proyecto de configuración web. Agregué el resultado primario del proyecto (que parece atraer las dependencias relevantes) y los archivos de contenido del proyecto (que extrae los archivos Web.config y .svc).

El problema es que, en lugar de aplicar la transformación XDT y crear Web.config utilizando Web.Release.config, simplemente copia Web.config, Web.Release.config y Web.Debug.config en el instalador sin haciendo cualquier transformación en absoluto.

¿Cómo consigo que aplique la transformación Web.config antes de crear el instalador?

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