¿Puedo guardar el archivo en una ubicación personalizada (/home/Users/user1/) con nombrefile1.txt.

Tengo este codigo:

chrome.fileSystem.chooseEntry({type:'openDirectory'}, function(entry) {
    chrome.fileSystem.getWritableEntry(entry, function(entry) {
        entry.getFile('file1.txt', {create:true}, function(entry) {
            entry.createWriter(function(writer) {
                writer.write(new Blob(['Lorem'], {type: 'text/plain'}));
            });
        });
    });
});

Con este código, recibo un mensaje por lo que necesito elegir el directorio, pero quiero sin eso, quiero declarar la ubicación del directorio en la configuración.

¿Alguna solución para esto?

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Según la respuesta aceptada de @Xan:

// set location
$('#location_field').on('click', function(){
    chrome.fileSystem.chooseEntry({type:'openDirectory'}, function(entry) {
        chrome.storage.sync.set({'print_location': chrome.fileSystem.retainEntry(entry)});
    });
});

// get location 
var print_location = null;
chrome.storage.sync.get({
    print_location: null
}, function(items){
    chrome.fileSystem.restoreEntry(items.print_location, function(entry){
        print_location = entry;
    });
});

// save file
chrome.fileSystem.getWritableEntry(print_location, function(entry) {
    entry.getFile('file1.txt', {create:true}, function(entry) {
        entry.createWriter(function(writer) {
            writer.write(new Blob(['Lorem'], {type: 'text/plain'}));
        });
    });
});