Mangosta: ¿Cómo consultar una propiedad objeto referenciada?

Estoy tratando de obtener una lista de documentos de mi base de datos basada en la propiedad de un sub-documento. Los modelos y esquemas que estoy usando son:

var elementSchema = new mongoose.Schema({
    name: String,
    description: String,

    _story: { type: mongoose.Schema.Types.ObjectId, ref: 'Story' },

    date_created: Date,
    date_modified: Date,
};
var storySchema = new mongoose.Schema({
    title: {type: String, default: '', trim: true},
    isPrivate: {type: Boolean, default: false},
});

mongoose.model("Story", storySchema);
mongoose.model("Element", elementSchema);

Estoy tratando de obtener todos los elementos que pertenecen a una historia que no es privada, y de acuerdo con algunas publicaciones que vi por aquí (1, 2, 3) la solución sería usar _story.isPrivate con find. Actualmente estoy haciendo esto:

Element.find({'_story.isPrivate': false})
         .populate('_story')
         .exec(function(err, elements){
             if(err){
                 return next(err);
             }
             else if(elements.length > 0){
                 return res.send(elements);
             }
             else{
                 return res.send(404, {message: "No elements found"});
             }
});

Pero el resultado es siempre un conjunto vacío (devuelve 404). Sin ninguna condición, find devuelve todos los elementos y rellena la historia correctamente. También activé la salida de depuración para ver las consultas que se están ejecutando y obtengo esto:

Mongoose: elements.find({ '_story.isPrivate': false }) { fields: undefined, safe: undefined }

Intentando ejecutar esto en MongoDB no obtengo resultados. ¿Qué puede estar mal aquí?

Gracias

Respuestas a la pregunta(2)

Su respuesta a la pregunta