Bundler: está intentando instalar en modo de implementación después de cambiar su Gemfile

Soy bastante nuevo en bundler y capistrano, y estoy tratando de usarlos juntos. Cuando intento desplegar, recibo el mensaje:

Está intentando instalar en modo de implementación después de cambiar su Gemfile. Ejecute `bundle install 'en otro lugar y agregue el archivo Gemfile.lock actualizado al control de versiones.

No sé cómo satisfacer el sistema que se queja, y no entiendo por qué surge la queja porque leoEl documento:

Si existe un Gemfile.lock y ha actualizado su Gemfile (5), Bundler usará las dependencias en el Gemfile.lock para todas las gemas que no actualizó, pero volverá a resolver las dependencias de gemas que actualizó . Puede encontrar más información sobre este proceso de actualización a continuación en ACTUALIZACIÓN CONSERVADORA.

Interpreto que eso significa que el Bundler puede manejar el hecho de que mi Gemfile no es lo que esperaba. ¿Alguna ayuda?

Especificaciones: Ruby 1.9.3, Rails 3.2.3, Capistrano 2.12.0, Bundler 1.1.4, Windows 7, implementando en una máquina Posix.

Editar: Mi Gemfile incluye bloques lógicos como los siguientes:

unless RbConfig::CONFIG['host_os'] === 'mingw32'
  # gem 'a' ...
end

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