Cuando trabajo con R, con frecuencia aparece el mensaje de error "subíndice fuera de límites".Por ejemplo:

# Load necessary libraries and data
library(igraph)
library(NetData)
data(kracknets, package = "NetData")

# Reduce dataset to nonzero edges
krack_full_nonzero_edges <- subset(krack_full_data_frame, (advice_tie > 0 | friendship_tie > 0 | reports_to_tie > 0))

# convert to graph data farme 
krack_full <- graph.data.frame(krack_full_nonzero_edges) 

# Set vertex attributes
for (i in V(krack_full)) {
    for (j in names(attributes)) {
        krack_full <- set.vertex.attribute(krack_full, j, index=i, attributes[i+1,j])
    }
}

# Calculate reachability for each vertix
reachability <- function(g, m) {
    reach_mat = matrix(nrow = vcount(g), 
                       ncol = vcount(g))
    for (i in 1:vcount(g)) {
        reach_mat[i,] = 0
        this_node_reach <- subcomponent(g, (i - 1), mode = m)

        for (j in 1:(length(this_node_reach))) {
            alter = this_node_reach[j] + 1
            reach_mat[i, alter] = 1
        }
    }
    return(reach_mat)
}

reach_full_in <- reachability(krack_full, 'in')
reach_full_in

Esto genera el siguiente errorError in reach_mat[i, alter] = 1 : subscript out of bounds.

Sin embargo, mi pregunta no es acerca de este fragmento de código en particular (aunque sería útil resolverlo también), pero mi pregunta es más general:

¿Cuál es la definición de un error de subíndice fuera de límites? ¿Qué lo causa?¿Hay alguna forma genérica de abordar este tipo de error?