Este es mi código existente para comprimir una carpeta que he reunido principalmente de la ayuda aquí:

#!/usr/bin/env python

import os
import sys
import datetime

now = datetime.datetime.now().strftime("%Y-%m-%d_%H-%M")
target_dir = '/var/lib/data'
temp_dir='/tmp'

zip = zipfile.ZipFile(os.path.join(temp_dir, now+".zip"), 'w', zipfile.ZIP_DEFLATED)
rootlen = len(target_dir) + 1
for base, dirs, files in os.walk(target_dir):
   for file in files:
      fn = os.path.join(base, file)
      zip.write(fn, fn[rootlen:])

Si quisiera eliminar el archivo zip que acabo de crear al final de la operación, ¿sería este el mejor comando?

os.remove.join(temp_dir, now+".zip")