Creo que este post es la resolución a mi problema.Parpadeo al navegar entre páginas . Específicamente:

<code>$(document).bind("mobileinit", function()
{
   if (navigator.userAgent.indexOf("Android") != -1)
   {
     $.mobile.defaultPageTransition = 'none';
     $.mobile.defaultDialogTransition = 'none';
   }
});
</code>

Vengo del mundo C # y bastante despistado en cuanto ajQuery móvil. Me gustaría agregar este fragmento pero no estoy seguro de dónde. Si importa creo que lo añadiría ajquery.mobile-1.1.0.rc.1.js pero entonces no sé dónde está ahí, si ese es el archivo correcto.