Ich will Lethal Dose finden LD50) mit seinem Konfidenzintervall inR. Andere Softwarelinien von Minitab, SPSS und SAS bieten drei verschiedene Versionen solcher Konfidenzintervalle. Ich konnte solche Intervalle in keinem Paket in @ findR (Ich habe auch @ verwendefindFn Funktion vonsos package).

Wie finde ich solche Intervalle? Ich habe für einen Intervalltyp basierend auf der Delta-Methode codiert (da ich nicht sicher bin, ob er korrekt ist), möchte aber eine beliebige etablierte Funktion von @ verwendeR package. Vielen Dan

MWE:

dose <- c(10.2, 7.7, 5.1, 3.8, 2.6, 0)
total <- c(50, 49, 46, 48, 50, 49) 
affected <- c(44, 42, 24, 16, 6, 0)
finney71 <- data.frame(dose, total, affected)


fm1 <- glm(cbind(affected, total-affected) ~ log(dose),
 family=binomial(link = logit), data=finney71[finney71$dose != 0, ])
summary(fm1)$coef

             Estimate Std. Error   z value     Pr(>|z|)
(Intercept) -4.886912  0.6429272 -7.601035 2.937717e-14
log(dose)    3.103545  0.3877178  8.004650 1.198070e-15


library(MASS)
xp <- dose.p(fm1, p=c(0.50, 0.90, 0.95))  # from MASS
xp.ci <- xp + attr(xp, "SE") %*% matrix(qnorm(1 - 0.05/2)*c(-1,1), nrow=1)
zp.est <- exp(cbind(xp, attr(xp, "SE"), xp.ci[,1], xp.ci[,2]))
dimnames(zp.est)[[2]] <- c("LD", "SE", "LCL","UCL")
zp.est  

                 LD       SE      LCL       UCL
p = 0.50:  4.828918 1.053044 4.363708  5.343724
p = 0.90:  9.802082 1.104050 8.073495 11.900771
p = 0.95: 12.470382 1.133880 9.748334 15.952512