вопрос строится изпредыдущий вопрос, Я не хочу редактировать предыдущий вопрос, потому что тогда я буду вводить новую сложность в вопрос, который уже имеет так много комментариев. Это исказило бы контекст текущих ответов.

Следующий файл сопоставления называетсяmapping.txt

src/a/  tgt/aye/
src/b   tgt/b/
src/c/  tgt/c

Структура исходного файла выглядит следующим образом

/tmp/testzone/src/a/afile.txt
/tmp/testzone/src/b/bfile.txt
/tmp/testzone/src/c/cfile.txt

Первое, что мы делаем, это создаем целевую структуру каталогов на основеmapping.txt файл,

cut -f 2 mapping.txt | tr '\n' '\0' | xargs -0 mkdir -p

Который создает целевую структуру каталогов

/tmp/testzone/tgt/aye/
/tmp/testzone/tgt/b/
/tmp/testzone/tgt/c/

Далее мы бежим

 xargs --arg-file mapping2.txt cp -a

Который, кажется, помещает содержимое исходного каталога в целевой каталогc каталог. Это не верно. Следует использоватьmapping.txt файл для копирования из источника в цель построчно.

/tmp/testzone/tgt/aye/
/tmp/testzone/tgt/b/
/tmp/testzone/tgt/c/a/afile.txt
/tmp/testzone/tgt/c/aye/
/tmp/testzone/tgt/c/b/bfile.txt
/tmp/testzone/tgt/c/c/cfile.txt

Что может быть причиной этой проблемы?