Я вызываю python из php с помощью команды "exec ('python args')". Эта команда не работает более 1 минуты, но все еще python работает в фоновом режиме и php прерывается. В этом случае несколько раз было несколько вызовов Python. Для увеличения времени выполнения я изменил:

/etc/php5/fpm/php.ini : max_execution_time = 900/etc/php5/fpm/pool.d/www.conf : request_terminate_timeout=900/etc/nginx/nginx.conf : http{ fastcgi_read_timout=900;}

Если время выполнения меньше 1 минуты, нет проблем с python и php, оба работают.