Я использую этот код для итерации всех узлов TreeView.

for (TreeItem<DynamicTreeNodeModel> children1 : children)
                {
                    ObservableList<TreeItem<DynamicTreeNodeModel>> children2 = children1.getChildren();

                    for (TreeItem<DynamicTreeNodeModel> children3 : children2)
                    {
                        ObservableList<TreeItem<DynamicTreeNodeModel>> children4 = children3.getChildren();

                        TreeItem<DynamicTreeNodeModel> tempValue = null;

                        for (TreeItem<DynamicTreeNodeModel> children5 : children4)
                        {
                            // some logic
                        }
                    }
                }

Есть ли лучший способ получить доступ к узлам нижнего уровня TreeView?