Скажи, что я делаю это:

[self.collectionView setCollectionViewLayout:myNewLayout animated:YES];

Какова продолжительность анимации?

Я применяю это так, что я анимирую свойства слоя внутри ячеек, когда это меняется, и потому, что анимация слоя не попадает подUIViewЭто анимация на основе блоков, я должен делать это отдельно с моим собственным блоком анимации.