У меня есть объект классаbig.matrix вR с размерностью778844 x 2, Все значения являются целыми числами (километрами). Моя цель - вычислить евклидову матрицу расстояний, используяbig.matrix и иметь в результате объект классаbig.matrix, Я хотел бы знать, есть ли оптимальный способ сделать это.

Причина моего выбора использования классаbig.matrix это ограничение памяти. Я мог бы превратить мойbig.matrix к объекту классаmatrix и рассчитать евклидову матрицу расстояний, используяdist(), Тем не мение,dist() вернет объект размера, который не будет размещен в памяти.

редактировать

Следующий ответ дал Джон У. Эмерсон, автор и сопровождающийbigmemory пакет:

Я мог бы использовать большую алгебру, я ожидаю, но это также было бы очень хорошим вариантом использования Rcpp через sourceCpp (), и очень коротким и простым. Но, короче говоря, мы даже не пытаемся предоставить высокоуровневые функции (кроме основ, которые мы реализовали в качестве подтверждения концепции). Ни один алгоритм не может охватить все варианты использования, если вы начинаете говорить о нехватке памяти.