Я пытаюсь загрузить hdf5 в R и столкнулся с некоторыми проблемами. Вот шаги, которые я предпринял для настройки моей среды:

R 2.10.0 (x64) в Mac OS X 10.6hdf5 1.8.3 установлен через macportshdf5_1.6.9.tar.gz от CRAN

Я подозреваю, что проблема, с которой я столкнулся, связана с несовместимостью в моей версии HDF5 и той, которую ожидает модуль R. Для полноты вот как я установил модуль R:

R CMD INSTALL --configure-vars = 'CPPFLAGS = -I / Opt / местные / включить» --configure-арг =»--with-hdf5 = / Opt / местный» hdf5_1.6.9.tar.gz

Это прекрасно строит. Библиотека, кажется, загружается без проблем, но при попытке загрузить файл данные не возвращаются:

библиотека (hdf5)

hdf5load (»test.h5" )

НОЛЬ

Еще,

osx: data scott $ h5dump test.h5 HDF5 "test.h5" {ГРУППА "/" {DATASET "DSET» {DATATYPE H5T_STD_I32LE DATASPACE SIMPLE {(31) / (31)} DATA {(0): 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, 128, 256, 512, 1024, 2048, 4096, 8192, (14 ): 16384, 32768, 65536, 131072, 262144, 524288, 1048576, 2097152, (22): 4194304, 8388608, 16777216, 33554432, 67108864, 134217728, (28): 268435456, 536870912, 1073741824}}}}

Какие-нибудь мысли?

Заранее спасибо.