Aqui está uma captura de tela do que está acontecendo:

Basicamente, eu executo tudo via linha de comando, mas edito a fonte no eclipse.
Este erro impede o preenchimento automático, que é irritante.

Eu fui parawindow>preferences>PyDev>Interpreter - Python e definir os valores corretos, mas eles não ficam e mesmo quando eu clico em aplicar, eles não parecem levar para a sessão atual.

Alguma idéia do que poderia causar essa mensagem de erro?