Aviso 'Linha final incompleta' ao tentar ler um arquivo .csv no R

Estou tentando ler um arquivo .csv no R e após usar esta fórmula:

pheasant<-read.table(file.choose(),header=TRUE,sep=",")

Recebo esta mensagem de aviso:

"incomplete final line found by readTableHeader on 'C:\Documents and Settings..."

Há algumas coisas que pensei que poderiam ter causado esse aviso, mas, infelizmente, eu não sei o suficiente sobre o R para diagnosticar o problema, então pensei em publicar aqui na esperança de que alguém possa diagnosticá-lo para mim!

arquivo .csv era originalmente um arquivo do Excel, que eu salvei no formato .csv o arquivo compreende três colunas de dados cada coluna de dados tem um comprimento diferente, ou seja, há um número diferente de valores em cada colunaEu quero comparar as médias (usando o teste t ou equivalente, dependendo da distribuição normal / não normal) de duas das colunas por vez, por exemplo, teste t entre os valores da coluna 1 e os valores da coluna 2 e, em seguida, t -teste dos valores das colunas 1 e 3, etc.

Qualquer ajuda ou sugestão seria seriamente apreciada!