Este é um erro muito estranho ao tentar instalar uma biblioteca R específica na instância do AWS EC2 (Amazon Linux AMI). Um link noFóruns da AWS aqui, postado por outra pessoa, na verdade destaca bem meu problema.

A parte principal / relevante da mensagem de erro é:

data.table.h:6:12: fatal error: omp.h: No such file or directory
#include <omp.h> 

Eu fiz algumas pesquisas (embora não tenha certeza), acho que isso está relacionado à existência ou não de um compilador habilitado para OpenMP no servidor. oTabela de dados página de instalação no próprio GitHub discute isso um poucoaqui, mas não sei como atualizar ou corrigir isso na minha instância do EC2.

Qualquer ajuda com isso é apreciada.

EDIT - este é um novo problema, pois consegui instalar com sucessoTabela de dados em uma instância anterior semelhante do EC2 há menos de um mês.

EDIT 2 - Eu resolvi esse problema pegando uma instância anterior do meu EC2 com o data.table já instalado e criando uma AMI personalizada a partir dele. Ao usar essa AMI personalizada ao iniciar novas instâncias, elas já vieram com a biblioteca data.table instalada. Se eu notar que a AWS resolve esse problema por conta própria, tentarei lembrar de voltar e atualizar esta postagem!