Quero converter um vídeo (digamos, do formato wmv para flv) enquanto um usuário o carrega. Posso converter um vídeo ou enviá-lo individualmente, mas como fazê-lo de uma só vez?

Estou usando o ffmpeg para conversão, como:

ffmpeg -i WMV.wmv WMV.flv

Mas não tenho certeza sobre as etapas a serem seguidas para converter e enviar um vídeo. Preciso usar o Ajax ou algo assim?