Eu tenho uma plotagem sankey criada emnetworkD3 pacote. Gostaria de modificar as cores e a transparência dos nós e dos links.

Meus dadosnetworkD3_data é anexado no final.

Pergunta 1: Como modificar as cores dos nós com a paleta definida pelo usuário?

Não sei como modificar as cores com a paleta definida pelo usuário. É necessário usar a mesma paleta de cores específica para cada fonte de nó para manter a consistência com outros gráficos que tenho.

Atualmente, sou capaz de ter cada nó de origem com uma cor diferente e todos os nós de destino com a mesma cor, definindo oNodeGroup. O gráfico abaixo está próximo do que eu quero, no entanto, agora eu quero especificar a cor de cada nó de origem.

library(networkD3)
sankeyNetwork(Links = networkD3_data$links, Nodes = networkD3_data$nodes, Source = "source", Target = "target", Value = "value", NodeID = "name", NodeGroup="group", fontSize=14)

?sankeyNetwork diz que há umcolourScale parâmetro que recebe "sequência de caracteres que especifica a escala de cores categórica para os nós". Entendi que isso significa que posso adicionar uma coluna com as cores desejadas aonetworkD3_data$nodes quadro de dados e chamadacolourScale assim sendo:

sankeyNetwork(Links = networkD3_data$links, Nodes = networkD3_data$nodes, Source = "source", Target = "target", Value = "value", NodeID = "name", NodeGroup="group", fontSize=14, colourScale="colors")

Mas isso não funciona, nenhum enredo é produzido. Pesquisei stackoverflow e encontrei uma resposta de 2014:aqui, mas acho que isso não funciona mais, pois recebo um erroError: unexpected symbol chamando uma dessas soluções propostas (ou talvez eu simplesmente não saiba como implementá-la corretamente).

d3.scale.ordinal().range(["#7d3945","#e0677b", "#244457"])
d3.scaleOrdinal().range(["#7d3945","#e0677b", "#244457"])  

Pergunta 2: É possível definir a ordem em que a origem e os destinos são exibidos?

Para que as fontes sejam listadas de Source0 a Source10 e os destinos de Target11 para Target47? Onde está esse conjunto? Eu sei que isso é contra-intuitivo, permitindo que o algoritmo posicione os nós de maneira ideal.

Pergunta 3: Como modificar as cores dos links com a paleta definida pelo usuário e alterar a transparência / opacidade?

Também quero codificar por cores os links que emanam da fonte usando o mesmo esquema de cores da fonte. Eu sou capaz de fazer isso definindoLinkGroup, veja o gráfico abaixo. Novamente, estou perto do que quero, mas só preciso especificar as cores usadas e não tenho certeza de onde modificar isso. Também quero ajustar a opacidade para que a cor de origem seja mais sólida que as cores do link.

sankeyNetwork(Links = networkD3_data$links, Nodes = networkD3_data$nodes, Source = "source", Target = "target", Value = "value", NodeID = "name", NodeGroup="group", LinkGroup="group", fontSize=14)

Aqui estão meus dados -dput(networkD3_data)

structure(list(nodes = structure(list(name = c("Source0", "Source1", 
"Source2", "Source3", "Source4", "Source5", "Source6", "Source7", 
"Source8", "Source9", "Source10", "Target11", "Target12", "Target13", 
"Target14", "Target15", "Target16", "Target17", "Target18", "Target19", 
"Target20", "Target21", "Target22", "Target23", "Target24", "Target25", 
"Target26", "Target27", "Target28", "Target29", "Target30", "Target31", 
"Target32", "Target33", "Target34", "Target35", "Target36", "Target37", 
"Target38", "Target39", "Target40", "Target41", "Target42", "Target43", 
"Target44", "Target45", "Target46", "Target47"), group = c("Source0", 
"Source1", "Source2", "Source3", "Source4", "Source5", "Source6", 
"Source7", "Source8", "Source9", "Source10", "Target", "Target", 
"Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", 
"Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", 
"Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", 
"Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", 
"Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target", "Target"
), colors = c(",#9E0142", "#D53E4F", "#F46D43", "#FDAE61", "#FEE08B", 
"#FFFFBF", "#E6F598", "#ABDDA4", "#66C2A5", "#3288BD", "#5E4FA2", 
"#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", 
"#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", 
"#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", 
"#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", 
"#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", 
"#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", "#969696", 
"#969696")), .Names = c("name", "group", "colors"), row.names = c(NA, 
-48L), class = "data.frame"), links = structure(list(source = c(0, 
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 
1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 
2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 
3, 3, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 6, 
6, 6, 6, 7, 7, 7, 7, 7, 7, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 
8, 9, 9, 9, 9, 9, 9, 9, 9, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10
), target = c(11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 
23, 13, 18, 15, 11, 12, 24, 21, 25, 26, 27, 19, 28, 16, 22, 29, 
30, 31, 32, 18, 16, 15, 13, 27, 29, 19, 33, 34, 31, 35, 21, 24, 
11, 30, 36, 28, 37, 38, 39, 40, 26, 41, 11, 12, 15, 18, 19, 14, 
13, 16, 27, 34, 20, 22, 25, 12, 27, 16, 18, 13, 11, 12, 11, 14, 
27, 21, 16, 18, 22, 13, 15, 19, 16, 11, 12, 39, 12, 14, 18, 11, 
42, 43, 44, 13, 11, 18, 15, 12, 19, 45, 31, 16, 20, 46, 40, 47, 
11, 12, 18, 16, 14, 19, 15, 11, 12, 16, 13, 18, 14, 34, 31, 15
), value = c(5.8, 3.2, 5, 2.4, 2.5, 2.7, 3.5, 2.5, 3.5, 1.4, 
2.9, 2.4, 1.3, 12.1, 7.4, 5, 11.2, 5.6, 6.4, 8.8, 2.6, 3.5, 7, 
10, 4.5, 6, 6.5, 5.8, 5.4, 6.2, 8.9, 5.5, 4.8, 3.4, 6.5, 5, 4, 
6.4, 7.3, 4.4, 4.2, 1.7, 5.1, 3.6, 6.4, 3.4, 2.5, 2.6, 2.3, 2.3, 
3.2, 1.6, 1.7, 3.7, 8, 4.4, 3.1, 4.1, 5.9, 2.8, 5, 3.2, 3.7, 
3.4, 1.8, 3.2, 1.2, 4.1, 5.2, 4.5, 4.8, 7.1, 7.3, 4.6, 8.4, 3.4, 
5.2, 6.1, 4.3, 4.5, 4.5, 6.5, 2.8, 6.3, 5.3, 8.2, 3.8, 4.3, 4.2, 
3.4, 5.4, 7.9, 1.2, 1.4, 1.4, 6.6, 6.8, 4.2, 2.9, 3.1, 5.3, 2.6, 
3.2, 2.9, 1.7, 1.9, 1.4, 8, 8, 4, 5, 4.3, 2.9, 6.9, 3, 8.7, 4.5, 
4.2, 6.6, 4.4, 2.7, 4.4, 4.3, 2.8), group = c("Source0", "Source0", 
"Source0", "Source0", "Source0", "Source0", "Source0", "Source0", 
"Source0", "Source0", "Source0", "Source0", "Source0", "Source1", 
"Source1", "Source1", "Source1", "Source1", "Source1", "Source1", 
"Source1", "Source1", "Source1", "Source1", "Source1", "Source1", 
"Source1", "Source1", "Source1", "Source1", "Source1", "Source2", 
"Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source2", 
"Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source2", 
"Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source2", 
"Source2", "Source2", "Source2", "Source2", "Source3", "Source3", 
"Source3", "Source3", "Source3", "Source3", "Source3", "Source3", 
"Source3", "Source3", "Source3", "Source3", "Source3", "Source4", 
"Source4", "Source4", "Source4", "Source4", "Source4", "Source5", 
"Source5", "Source5", "Source5", "Source5", "Source5", "Source5", 
"Source5", "Source5", "Source5", "Source5", "Source6", "Source6", 
"Source6", "Source6", "Source7", "Source7", "Source7", "Source7", 
"Source7", "Source7", "Source7", "Source8", "Source8", "Source8", 
"Source8", "Source8", "Source8", "Source8", "Source8", "Source8", 
"Source8", "Source8", "Source8", "Source9", "Source9", "Source9", 
"Source9", "Source9", "Source9", "Source9", "Source9", "Source10", 
"Source10", "Source10", "Source10", "Source10", "Source10", "Source10", 
"Source10", "Source10")), .Names = c("source", "target", "value", 
"group"), row.names = c(NA, -124L), class = "data.frame")), .Names = c("nodes", 
"links"))