Imaginando se algum guru por aí poderia lançar uma ideia sobre o motivo pelo qual o seguinte acontece aleatoriamente.

Temos um aplicativo da web que implementamos no Jetty 6.1.26 em execução em uma instalação do Linux com o JRE 1.7_03

Nem sempre, mas de vez em quando, quando o Jetty é iniciado - o que parece ser uma classe aleatória (do nosso projeto) parece ser a fonte de um erro NoClassDefFound. Se reiniciarmos o Jetty, o problema desaparece.

O único padrão que ocorre parece ser que as classes na raiz do erro são preenchidas por meio de anotações JAXB.

Para dar mais uma idéia da frequência, parece que isso acontece 1/50 vezes, se é que isso acontece.

Eu estaria interessado em saber o como e o porquê desse erro.