Por que estou recebendo "Importação inesperada de token" em um projeto de webpack, mas não no outro?

Tenho 2 projetos que estão trabalhando de maneira diferente e não sei dizer o que é diferente. Eu tenho o seguinte em um projeto ...

// In .ts wile
import 'core-js/es6';
import 'reflect-metadata';

Isso funciona muito bem em um projeto, no entanto, outro projeto com o mesmo tsconfig.json e typings.json, bem como o ts-loader configurado na configuração do webpack, recebo ...

SyntaxError não capturado: importação de token inesperada

A JS transpilada na falha se parece com isso ...

/***/ function(module, exports, __webpack_require__) {

    /* WEBPACK VAR INJECTION */(function(process) {import 'core-js/es6';
    import 'reflect-metadata';

Vou postar o projeto seguinte um pouco

Então, minha pergunta é o que estou perdendo? As definições de texto datilografado não estão sendo importadas corretamente? Eu já tentei corrertypings install novamente apenas para descartar isso.

Mais informações

//tsconfig
{
  "compilerOptions": {
    "target": "es5",
    "module": "commonjs",
    "moduleResolution": "node",
    "sourceMap": true,
    "emitDecoratorMetadata": true,
    "experimentalDecorators": true,
    "removeComments": false,
    "noImplicitAny": true,
    "suppressImplicitAnyIndexErrors": true
  }
}

// Typings.json
{
  "globalDependencies": {
    "core-js": "registry:dt/core-js#0.0.0+20160602141332",
    "jasmine": "registry:dt/jasmine#2.2.0+20160621224255",
    "node": "registry:dt/node#6.0.0+20160621231320"
  }
}