Google App Engine no domínio do Google Apps

Estou tendo problemas para direcionar meu domínio para o meu site hospedado no Google App Engine. Aqui está o plano de fundo ... separe os conceitos de "google apps" (hospedagem de domínio, email etc.) e "google app engine" (estrutura do site).

Eu tenho um domínio que usa o Google Apps para seu domínio, vamos chamá-lo de empresa.com. Portanto, meu login para minha conta do Google Apps é bob@company.com. Eu tenho um domínio diferente que está associado à minha conta do Google Apps, vamos chamá-lo de mycompany.com. Ele foi aliasado e registrado com êxito na minha conta principal do Google Apps usando o método cname e atualizou os registros MX. Temos muitos domínios e só quero usar uma conta "google apps" para manter todos eles.

Agora eu tenho um site que eu criei usando o Google App Engine, e o URL é efetivamente mycompany.appspot.com. Quero que minhaempresa.com aponte para meu site que atualmente reside em mycompany.appspot.com.

Há um ponto no painel do mecanismo de aplicativos do Google nas configurações do aplicativo onde você pode adicionar um domínio. Então, clico lá e entro em mycompany.com e recebo uma mensagem de erro informando que o domínio não está usando o Google Apps.

Se eu voltar para a página que enviei, há uma observação dizendo que preciso registrar o domínio no Google Apps. Então, clico no link para fazer isso e entro em mycompany.com e recebo uma mensagem de erro informando que o domínio foi registrado e está em processo de verificação de propriedade. Mas esse processo já está concluído.

Então o que eu faço? O mecanismo de aplicativos do Google não suporta um domínio com alias apenas a uma conta principal do Google Apps? Mycompany.com precisa ter sua própria conta principal do Google Apps?