Anexando o ouvinte à camada KML:

var layer = new google.maps.KmlLayer('http://sites.google.com/site/kmlprototypes/kmls/temp.kml?dc_=' + Math.random(),
{suppressInfoWindows:true,preserveViewport:true});

layer.setMap(map);

google.maps.event.addListener(layer, 'click', function (obj) {
    alert(obj.featureData.id);
});

O arquivo KML é válido (verificado pela validação api), você pode encontrá-loAqui. Cada marcador em XML possui um atributo id como:

<Placemark id="46">
  <Style>
    <IconStyle>
      <Icon>
        <href>
          <![CDATA[http://chart.apis.google.com/chart?chf=bg,s,EAF7FE02&chxt=y&chbh=a,4,4&chs=48x48&cht=bvg&chco=FF0000,0000FF&chds=20,9048.00,0,9048.00&chd=t:8149.00|9048.00]]>
        </href>
      </Icon>
    </IconStyle>
  </Style>
  <Point>
    <coordinates>30.49566650390625,50.721378326416016</coordinates>
  </Point>
</Placemark>

Ao clicar em um marcador no objeto google map, ele retorna o ID certo, mas, às vezes, cerca de 50% do tempoobj.featuredData.id énull (ZERO_RESULTS status está emstatus campo). Eu tentei diferentes conjuntos de dados (de 100 pontos para 1000), mas isso não ajuda. Também tentei diferentes precisões para lat, lng.