Eu configurei o servidor de identidade do ThinkTecture como um STS, configurei um projeto de API da web e usei a ferramenta "identidade e acesso" no visual studio e apontei para meus metadados de federação para habilitar a autenticação federada usando o WIF. Esta é a aparência da parte relacionada do web.config:

<system.identityModel>
    <identityConfiguration saveBootstrapContext="true">
      <audienceUris>
        <add value="http://localhost:41740/" />
      </audienceUris>

    <securityTokenHandlers>
        <add type="System.IdentityModel.Tokens.SamlSecurityTokenHandler, System.IdentityModel, Version=4.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=B77A5C561934E089" />
        <add type="System.IdentityModel.Tokens.Saml2SecurityTokenHandler, System.IdentityModel, Version=4.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=B77A5C561934E089" />
    </securityTokenHandlers>            

      <issuerNameRegistry type="System.IdentityModel.Tokens.ValidatingIssuerNameRegistry, System.IdentityModel.Tokens.ValidatingIssuerNameRegistry">
        <authority name="http://auth.myserver.com/samples">
          <keys>
            <add thumbprint="F89C10B505E015774D02E323DEDA32878F794028" />
          </keys>
          <validIssuers>
            <add name="http://auth.myserver.com/samples" />
          </validIssuers>
        </authority>
      </issuerNameRegistry>
      <!--certificationValidationMode set to "None" by the the Identity and Access Tool for Visual Studio. For development purposes.-->
      <certificateValidation certificateValidationMode="None" />
    </identityConfiguration>
  </system.identityModel>
  <system.identityModel.services>
    <federationConfiguration>
      <cookieHandler requireSsl="false" />
      <wsFederation passiveRedirectEnabled="true" issuer="https://10.40.40.68/issue/wsfed" realm="http://localhost:41740/" requireHttps="false" />
    </federationConfiguration>
  </system.identityModel.services>

Isso funciona muito bem para autenticar usuários que usam a API do navegador.

Agora preciso chamar a mesma API do código (C #) em um aplicativo cliente - vamos chamar esse APIClient - usando HTTPClient.

Para fazer isso, adicionei isso ao web.config:

<securityTokenHandlers>
        <!--<add type="System.IdentityModel.Tokens.JwtSecurityTokenHandler, System.IdentityModel.Tokens.Jwt" />-->
        <add type="System.IdentityModel.Tokens.SamlSecurityTokenHandler, System.IdentityModel, Version=4.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=B77A5C561934E089" />
        <add type="System.IdentityModel.Tokens.Saml2SecurityTokenHandler, System.IdentityModel, Version=4.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=B77A5C561934E089" />
</securityTokenHandlers>

Minha suposição era de que, se eu adicionasse o manipulador de token SAML e adicionasse uma asserção de SAML ao cabeçalho HTTP Authorize, o WIF o pegaria e autenticaria a solicitação.

Eu posso chamar o STS para obter um token SAML conforme descrito no método GetSamlToken aqui:insira a descrição do link aqui

Isso me dá uma afirmação de SAML que eu atribuo ao cabeçalho HTTPClient:

client.SetToken("SAML", AuthenticationHeader);

OndeAuthenticationHeader é a declaração de SAML que recebi do servidor. O problema é que a web api não faz nada com a afirmação samle - como se nem sequer a visse, Tudo que eu recebo em resposta é um redirecionamento para o STS.

O que estou fazendo de errado? Como posso autenticar e chamar meu método de API da Web protegida de outro código sem precisar alternar para o JWT, etc.?

Agradeço antecipadamente por sua ajuda!

-- Atualizada

Eu adicionei o seguinte ao meu WebApiConfig.cs como sugerido pelo @Brock:

public static void Register(HttpConfiguration config)
{
    // Cross Origin Resource Sharing
    //CorsConfig.RegisterCors(GlobalConfiguration.Configuration);
    CorsConfig.RegisterCors(config);


    //CorsConfiguration corsConfig = new CorsConfiguration();
    //corsConfig.AllowAll();
    //var corsHandler = new CorsMessageHandler(corsConfig, config);
    //config.MessageHandlers.Add(corsHandler);


    // authentication configuration for identity controller
    var authentication = CreateAuthenticationConfiguration();
    config.MessageHandlers.Add(new AuthenticationHandler(authentication));



    // ASP.Net web api uses NewtonSoft Json.net natively, 
    // the following line forces the web api to use the xml serializer instead of data contract serializer
    config.Formatters.XmlFormatter.UseXmlSerializer = true;

    log.Debug("Registering Web API Routes");


    // register api routes

}




private static AuthenticationConfiguration CreateAuthenticationConfiguration()
{
    var authentication = new AuthenticationConfiguration
    {
        ClaimsAuthenticationManager = new ClaimsTransformer(),
        RequireSsl = false,
        EnableSessionToken = true
    };

    #region IdentityServer SAML
    authentication.AddSaml2(
        issuerThumbprint: "F89C10B505E015774D02E323DEDA32878F794028",
        issuerName: "https://10.40.40.68/issue/wsfed",
        audienceUri: "http://localhost:41740/",//Constants.Realm,
        certificateValidator: System.IdentityModel.Selectors.X509CertificateValidator.None,
        options: AuthenticationOptions.ForAuthorizationHeader("SAML"),
        scheme: AuthenticationScheme.SchemeOnly("SAML"));
    #endregion

    #region Client Certificates
    authentication.AddClientCertificate(ClientCertificateMode.ChainValidation);
    #endregion

    return authentication;
}

No entanto, ainda recebo uma resposta 302. É assim que faço o pedido:

ServicePointManager.ServerCertificateValidationCallback += (sender, certificate, chain, sslPolicyErrors) => true;


var factory = new WSTrustChannelFactory(
    new UserNameWSTrustBinding(SecurityMode.TransportWithMessageCredential),
    "https://10.40.40.68/issue/wstrust/mixed/username");
factory.TrustVersion = TrustVersion.WSTrust13;

factory.Credentials.UserName.UserName = "myusername";
factory.Credentials.UserName.Password = "password";

var rst = new RequestSecurityToken
{
    RequestType = RequestTypes.Issue,
    KeyType = KeyTypes.Bearer,
    TokenType = Thinktecture.IdentityModel.Constants.TokenTypes.Saml2TokenProfile11,
    AppliesTo = new EndpointReference("http://localhost:41740/")
};

var token = factory.CreateChannel().Issue(rst) as System.IdentityModel.Tokens.GenericXmlSecurityToken;

string myToken = token.TokenXml.OuterXml;

HttpClient client = new HttpClient(new HttpClientHandler
{
    ClientCertificateOptions = ClientCertificateOption.Automatic,
    AllowAutoRedirect = false
});

client.SetToken("SAML", myToken);
//client.SetBearerToken(myToken);

var resp = client.GetAsync("http://localhost:41740/api/clients", HttpCompletionOption.ResponseContentRead).Result;
Assert.IsTrue(resp.IsSuccessStatusCode);