Eu consegui obter o IDE para compilar o projeto java corretamente, modificando o config.ini, mas o próprio IDE ainda está mostrando erros sobre as instruções do processador:

//#ifdef VER_X
public class Video extends FirstCanvas {
//#else
public class Video extends SecondCanvas {
//#endif
...

Existe uma configuração ou um plug-in que resolveria isso?

EDIT: Talvez um pouco de esclarecimento: estou procurando algo que fará o editor IDE mais compatível com o código. Não me deixará seguir nenhuma definição por causa do que o editor THINKS é um erro.