CHOLMOD em Java

Já pedi algo parecido, mas desta vez serei mais específico.

Eu preciso realizar, dentro de umfor loop, a fatoração de Cholesky de uma matriz symmetrix positiva geralmente grande1000x1000). Agora, para fazer isso, eu tenho tentado:

1) Biblioteca Apache Math

2) Biblioteca Paralela do Colt

3) biblioteca JLapack

Em qualquer um dos três casos acima mencionados, o consumo de tempo é terrivelmente longo, se comparado ao MATLAB, por exemplo.

Portanto, estou me perguntando se existe alguma ferramenta externa altamente otimizada para a fatoração de Cholesky em Java: tenho pensado, por exemplo, naCHOLMOD algoritmo, que na verdade é chamado internamente dentroMATLAB e outras ferramentas.

Eu realmente aprecio ter um feedback completo sobre este assunto.

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