Eu estou tentando descobrir porque meu.libPath é diferente entre linha de comando R e RStudioÁrea de Trabalho (NOTA: isso énão uma duplicata deessa questão como essa correção envolvia coisas específicas para o RStudioServidor que eu não tenho).

Quando eu uso o R na linha de comando (linux):

> .libPaths()
[1] "/home/mathematicalcoffee/R/library"  "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib/R/site-library"             "/usr/lib/R/library"           

Quando eu uso o RStudioÁrea de Trabalho (linux, mesma máquina):

[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"       "/usr/lib/R/library"            "/usr/lib/rstudio/R/library"  

Agora eu tenho definido$R_LIBS_USER para~/R/library no meu perfil bash, então a linha de comando R a pega como minha libPath preferida.

O problema está no RStudio Desktop quando eu faço:

Sys.getenv('R_LIBS_USER')
# "~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15"

Então, por que o RStudio Desktop mudou meuR_LIBS_USER? Como posso mudar isso de volta? (Eu não uso um arquivo .Rprofile). (Na questão que eu coloquei acima a solução para o RStudio Server era modificar/etc/rstudio/rsession.conf, mas eu não tenho isso como eu tenho RStudio Desktop. Além disso, acredito que o RStudio deveria estar respeitando minhaR_LIBS_USER variável de ambiente.)